搞定了军区本部下属各个部门机构的编制之后，克洛德就把心思花在了部队编制的改革上面。由于自治领军区下属各部队，不管是两个主力军团还是地方守备部队，都已经装备了新式步枪和新式火炮的原因，导致后勤压力极其巨大。而克洛德也根据在纳瑟里地区和联盟军队交手的心得，准备对部队编制进行大手术。

现在自治领下属的两个主力军团和地方守备武装沿用的还是传统的火绳枪部队的编制，鉴于火力依靠齐射和战力依靠兵多的传统习惯，所以在各部队编制上以尽量的扩充兵员为主。比如一小队十二人的战斗编制，就是已经达到了一个士官长所能指挥的兵力极限。

克洛德一直觉得基层战斗小队十二人的编制非常的臃肿，有了新式火枪之后，基层战斗小队的火力已经得到极大的加强，再将小队编制为十二人很难保证灵活和快速的战场指挥反应。所以他决定，将基层战斗一小队改编为八人，小队长为士官长，副队长为士官。

此外，克洛德还想将所有的编制改为三三制，而不是现在的四四制，就是三小队为一中队，三中队为一大队，三大队为一营，三营为一团，三团为一师，三师为一军。不过此举遭到了军区参谋部大部分高级参谋军官的反对，他们担心这样改编会让基层部队缺乏足够的战力，克洛德思来想去，再三考虑之后还是决定采取四四制。

一小队八人，四小队为一中队，中队长为少尉军官，配备一名勤务兵，也可以当传令兵使用，一名警卫兵，一名通讯兵，一名医务兵，合计为三十七人。四中队为一大队，大队长为中尉或上尉军官，配备一名勤务兵，两名警卫兵，一名通讯兵，一名医务兵，一个火炮小队六人，装备一门新式步兵轻型野战火炮，合计为一百六十人。

四大队为一营，营长为上尉或者少校军官，配备一名勤务兵，一名副官，三名警卫兵，参谋军官六人，辅助人员十二人，一个后勤服务小队八人，一个通讯小队八人，一个军法小队八人，一个后勤小队八人，一个医疗小队八人，一个警备小队八人，一个火炮中队三十人，装备四门新式步兵轻型野战火炮，合计七百四十人。

四营为一团，团长为中校或者是上校军官，配备副官一名，勤务兵一名，团本部配备参谋军官十六名，辅助人员三十二名。另设一个通讯中队，一个军法中队，一个后勤中队，一个警备中队，一个后勤服务中队，一个警卫中队，一个医疗小队八人，一个直属野战大队一百六十人，一个火炮大队一百四十五人，装备十六门步兵轻型野战火炮，合计为三千四百八十五人，加机动名额十五人，总计为三千五百人为一个主力野战团。

四团为一师，师团长为上校军官或者少将军官，配备副官一名，勤务兵一名。从师团开始，指挥部与军区一样下设十二部门，各部门正副主管两人，文职军官四人，辅助人员十二人，合计为两百一十六人。师团指挥部下属一个警卫大队，一个通讯大队，一个军法大队，一个警备大队，一个后勤服务大队，一个后勤执行大队，两个后勤辎重运输大队，一个医疗中队三十五人。

另外师团指挥部还有直属的一个野战加强独立营八百人，一个直属火炮营六百八十人，装备六十四门步兵轻型野战火炮。合计一个主力野战师团的编制为一万七千余人，如果再加上聘请的马夫兽医厨师这些非作战人员的话，那一个师团的人员总编制为一万八千人左右。

克洛德心里很清楚，现在自治领军区两个主力野战军团的师团编制都是三万五千人左右，部队编制人员太多，非作战人员占据了三分之一名额，显得指挥机构非常的臃肿，很不灵活，同时对后勤军备物资补给形成了极大的压力。

就如同在波里维西亚王城战役中，克洛德是用一个团的兵力对抗联盟军队的一个军团的进攻，即便有着防御阵地和城